另一边，法国舰队跟福建水师主力舰队稍一接触，就发现他们可能要玩完了。因为技高一筹的法国舰队虽然率先命中了清军的福清号铁甲舰，但是眼看着巴雅号射出的240mm主炮的炮弹只在福清号的装甲上留下一个凹陷，炮弹被弹飞。法国人倒吸一口凉气，顿时觉得不妙了。
当双方的距离拉近到两海里多时，吴长庆下令福建水师主力舰队全力右满舵，跟法国舰队侧舷对侧舷，同向行驶。双方你来我往，打得好不热闹。只是射中清军的炮弹虽多，但是除了几发打到舰桥的造成一些破坏外，打中装甲的炮弹完全被无视了。清军的“金瓯”级，用的都是复合钢装甲，不是那些100多毫米口径的法国舰炮能轻易洞穿的。
而身处法国舰队另一边的湖南、湖北、江苏号，也重新编队完成，全力进攻位于法国编队中间部位的巴雅号。只是他们距离法国舰队足有三海里多，毕竟有些势单力薄，怕被法舰命中或包抄。
狐拔下令舰队略微调整航向，另法军编队与清军编队形成一定夹角，好缓慢接近清国编队，这样也许就可以另法国火炮击穿清国舰队的装甲。吴长庆很快就发现了法军的阴谋，也调整了编队航向，凭借航速优势，始终不让法国舰队过于接近，气得狐拔两眼发绿。
此时的巴雅号两面受敌，舰身不断被命中。狐拔坐镇驾驶室指挥，驾驶室却已经是四面透风，玻璃全部被震碎了，甲板上还有伤员留下的斑斑血迹。狐拔忍受着刺鼻的硝烟味和血腥味，五官纠结地观察者清国舰队的动向。
忽地窝尔达号屁股处腾起万丈烟火，一枚天地号发射的鱼*雷命中了窝尔达号的舰艉，窝尔达号瞬间失去动力，航速很快归零。这一枚鱼*雷令法国舰队上下气恼不已，他们还不知道清军有潜艇助阵，以为是清国舰队在很远的距离上发射的鱼*雷，误打误撞击中了窝尔达号。法国舰队只得抛下窝尔达号。
刚刚扑灭大火的台湾号见状，立刻发报给江苏号，要求与江苏号协同击沉窝尔达号这个瓮中之鳖，吴长庆得知后命令不要被窝尔达号吸引，全力攻击其它法舰。
就在台湾号奔回福建水师分舰队时，忽见法军胜利号一声巨响，冲击波震得方圆200米之内的海水都翻起浪花。原来是威远号发射的一枚305mm炮弹击中了胜利号的弹药库，胜利号发生了弹药殉爆，舰身瞬间被撕扯成两半。眼见着福建水师军舰也是个个冒烟，吴长庆心疼不已，趁此良机，发报鼓舞士气：法舰或停或沉，我军胜利在望！一时间清军士气如虹，迎着法舰的炮火，在接下来的两小时时间里，将凯旋号打成重伤，凯旋号舰长Baux阵亡；都威尔号被清军潜艇击中水线，舰身进水倾覆，来了个底朝天；香伯兰号、拉佩鲁兹号、梭尼先后起火，自顾不暇；杜居土路因号伤亡过大、火炮损毁严重，失去战斗力；阿塔朗特号、德斯丹号、尼埃利号、雷诺堡号、黎峨号和几艘炮艇都被击沉。整个法国舰队的航速都下降到8节左右。
吴长庆见状大喜，立刻下令挂旗催促法国舰队投降。狐拔怒不可遏却又无可奈何，他不愿投降，于是下令撤退。早已千疮百孔的巴雅号刚一掉头，就被湖北号射来的一发240mm炮弹击中舰面，狐拔本人也受重伤倒地。等舰员们踩着一地的断肢和内脏将他抬到医务室时，狐拔已经投入了上帝的怀抱。
眼见大势已去，巴雅号挂起了白旗。杜沙佛号和阿米林号见状也立刻投降；圣凯号在投降的同时请求清军帮忙打捞落水的法国水兵；拉佩鲁兹号几乎被大火烧毁，舰上官兵只能弃舰；香伯兰号和梭尼号也在大火中挂起白旗。
志得意满的吴长庆，此时立刻拿出了珍藏多年的美酒，本来打算殉国时再喝一碗壮行的，没想到能在打败法国舰队之后当庆功酒喝，他心里那个美啊！边喝着小酒边下令官兵登上法舰，并要求法舰随跟随我方。共俘获法舰巴雅号、窝尔达号、杜居土路因号、杜沙佛号、阿米林号、香伯兰号、梭尼号、圣凯号八艘，同时发报回福建报告战况。俘获法国水兵1562人，有2100多名法国水兵葬身大海。我方福清号、台湾号和江西号、福建号受伤较重，但装甲都未被洞穿。福建水师共阵亡161人，伤405人。相比于法军，此战堪称大捷了。
就在吴长庆乐的屁颠屁颠的时候，忽然收到台湾方面来报，告知他们基隆守住了，还击沉一艘法国巡洋舰。但是有两艘法国军舰跑了，希望福建水师能截住他们。吴长庆得报后王八之气一发，下令湖南、湖北、江苏三艘航速最快的军舰立刻追击！
那刘铭传究竟是如何赶走利士比的呢？
却说那日天亮之后，基隆要塞和法舰依旧对着放空炮，谁都没对谁造成太大损害，毕竟清军火炮精度太差，只命中了拉家里桑尼亚号一枚240mm炮弹和两枚152mm炮弹，皆未击中要害。费勒斯号巡洋舰和鲁汀号炮艇依旧悠悠然，没怎么受伤。上午八点，利士比下令军舰放下六艘小艇，法军开始登陆了。可悲的是一夜的炮火准备根本没有对基隆要塞造成实质性损伤，而六艘小艇上的法军加起来还不到一百人，这铁定了是一次死亡登陆。
利士比实在是小瞧了基隆的守军，狂傲的他还以为现在的清国是英法联军火烧圆明园那时的清国。狐拔也是没把基隆放在眼里，才会只派三艘军舰进攻基隆。
就在这六艘小艇距离基隆海岸还有一里时，刘铭传就下令要塞里的轻重机枪对那些小船集中火力。小艇上的法军士兵没想到清军会在如此远的距离上打出这么猛烈的火力，而且还格外精准，自然是纷纷中弹。
没过两分钟，领头的两艘小艇上的法军就死光了，其它法军一看不妙，立刻掉头往回划，边划边堵漏，因为木制的船体早被机枪打出了一串串的小窟窿。刚刚掉头往回划，又有一艘小艇上的法军全部阵亡，最后划回去的只有三艘，一共才生还二十多人。利士比震惊了，他实在没想到清军火力如此猛烈，但是又不能就这么撤退，于是下令先退出基隆港避一避，晚上回来偷袭。
此时已经是上午十一点多了，基隆港开始退潮，刘铭传得知法舰前来后，紧急下令在港湾布设了五十多枚水雷，布设深度为涨潮时两米多，退潮时就只有一米多，这样可以保证吃水很浅的渔船在出入时不会被水雷误击。中午时分，正是基隆退潮的时候，三艘法舰刚刚掉头往远海航行，就听“轰~~~”的一声，费勒斯号舰艏触发水雷，舰艏当时就不见了，变成一个大缺口，海水迅速灌入费勒斯号船体，两分钟的功夫，费勒斯号舰艉就翘起来了，舰上官兵纷纷跳水逃生。利士比一看就傻眼了，水雷这东西他在越南是见识过的。
不过损失这么大，他要是还攻不下基隆，回去说不定会上军事法庭，这下想走也走不了啦，只能等待夜幕降临再做拼死一搏了。不过加拉利桑尼亚号的舰长Fleuriais却不干了，要是加拉利桑尼亚号再触雷，他就不想活了，于是建议利比士放弃进攻基隆，去跟狐拔他们会合。二人争吵十分激烈，直到见到被捞上来的菲勒斯号的官兵，利士比才心有余悸地答应先去找狐拔他们会合。于是带着炮艇鲁汀号一起灰溜溜的离开了。丢下二百多具尸体不敢打捞。而清军这边也阵亡了一百多人。
前脚法舰刚走，基隆港里顿时就沸腾了。刘铭传迅速给福建和京师发报，然后派人划着渔船去把海上的法军浮尸捞起来。他没想到会赢的这么轻松，基隆人把费勒斯号触雷，看作是老天爷帮忙。吴子虚得报也是高兴的中午都没好好吃饭。
却说这加纳利桑尼亚号领着鲁汀号一路往西北走，希望在马尾附近能跟狐拔他们会合。到了下午四点半，终于看见了几艘军舰，可惜不是狐拔的舰队，却是前来追赶他们的湖北、湖南、江苏三艘铁甲巡洋舰。江苏号走在最前，眼见着加拉利桑尼亚号还带伤，鲁汀号个头太小，于是直接挂旗，示意让利士比投降。
利士比看见这几艘军舰上也有过被命中的痕迹，认为这几艘军舰是在狐拔对马尾的偷袭中逃出来的，根本没把他们放在眼里，投降给他们，自己以后怎么混啊。
于是利士比当即命人回复“拒绝投降”，接着就调转船头，准备用侧舷密集的火炮迎战，鲁汀号也赶紧配合。但是清军接下来的“旗语”，却给了法军当头一棒。原来江苏号见法军区区两艘小军舰都不肯投降，就知道他们以为狐拔舰队就在附近，于是直接挂上了上午海战中缴获的三面破败不堪法国国旗，好打击利士比他们的士气。
利士比士一看就明白狐拔他们战败了，虽然有点疑虑，但还是下令边打边撤。加纳利桑尼亚号和鲁汀号于是以十节出头的速度努力“狂奔”，自然是很快被清军赶上，三艘清国铁甲巡洋舰在后面鸣炮示威，利士比眼见要被追上，舰上的官兵也是半数带伤，只能自认倒霉，下令投降，乖乖跟着去了马尾军港，435名法国水兵成为俘虏。
海上大捷的消息纷纷传进京城，整个京城为之震动了。大清国自打道光朝与洋人开战以来，何曾在海上赢过？更何况是打败了强国法兰西。吴子虚下令连同南洋水师尾随法舰的那三艘军舰，给参战的水师官兵每人20块银元，基隆要塞的官兵每人赏十块银元，吴长庆、刘铭传赏戴双眼花翎。接着就去皇陵祭祖，告慰历代先皇。京城的报馆再一次连夜开工，印刷号外。百姓们上街舞狮庆贺，虽是夏天，气氛也如过大年一样热烈而喜庆。
日本和德国也被大清的胜利震住了，日本推翻了原定的所有趁中法战争浑水摸鱼的计划，德国开始考虑将清国引为得力的盟友，并声称只要清国保证不将德国刚刚建好的四艘“定远”级和十艘“金瓯”级用于中法战争，就放这些军舰回中国。吴子虚自然一口答应。
法国却动乱了，没有了远东的制海权，如何能够保障陆战的胜利？清国只出动了一支舰队，就打得法国远东舰队全军覆没，只出动了西南几省的非精锐部队，就占领了大半个越南。这仗，法国是明显打不起了。虽然有人提出法国增援的两万陆军已经到达印度，马上就可以进入越南参战了，但是法国的财力，实在是吃不消了。
有人推算过，清国最多可以投入20—25万陆军参战，要打败清国，最起码要8—10万法国陆军，再加上法国一半以上的海军，然而战胜的成果也仅仅是拿下越南，明显得不偿失。考虑到自从光绪皇帝当政以来，清国的外交态度十分强硬，恐怕不打到清国的首都，清国是不会赔一分银子的，而要占领清国的首都，依清军现在的规模和实力，怎么也得再投入12—15万军队，准备时间将在半年以上，这一仗，法兰西明显是打不起了。也许，这头睡狮真的醒了吧！最后的结果亦如历史上一样，茹费里内阁倒台。法国派遣德里固来华，目的当然是希望缔结和平条约。
光绪三年九月二十日，中法两国宣布暂时停战。只是在停战期间，吴子虚不许任何一艘法国船只进入越南，派遣南洋水师封锁了越南近海。同时动用福建水师的船只，加紧给越南的陆军运送给养。吴子虚从冯子材处得知，征越军队已经攻占越南滨海城市芽庄，距西贡近在咫尺，但已是强弩之末，无力继续进击。，在越南丛林中苦战的清军情况已经十分糟糕了，炎热的七八月份，严重的疟疾、痢疾、伤寒等等传染病在军队中传播，死于传染病的人数已经超过一千人，战死的人也才不过三百多人而已；清军的后勤补给根本跟不上，战斗进行到八月，战士们每天只能吃一顿饭，平均每人还剩下不到30发子弹，平均每门大炮剩下不到4发炮弹，进行的每一次炮击，都是在迫不得已的情况下，平时，炮弹是舍不得用的；战士们的军服也早已破烂了，虽然缝缝补补，却依旧像支乞丐部队，多数人的军靴都已经磨烂了，只能穿临时编的草鞋。虽然一路上法军的抵抗越来越不像样，但是丛林中的清军的士气也跌落到极点了。
吴子虚急命南洋水师给南征的清军补充武器装备，令就地休整，并从国内调发后备兵员补充，令其随时做好攻占西贡的准备。